Selain menempuh pendidikan formal dan pesantren, Gus Dur juga sempat melanjutkan studinya di luar negeri. Pada tahun 1963, Gus Dur mempelajari studi Islam di Universitas Al-Azhar di Kairo, Mesir.
Kemudian, Gus Dur pindah lagi ke Irak untuk belajar di Universitas Baghdad. Selain belajar, di luar negeri Gus Dur aktif di PPI dan banyak menulis disana.***